> 本当は、LINUXのみで使いたいのですが、windowsXPでないと動かないソフト（シリアル制御付き）があるため、windowsXPを入れています。

自作モノならUSBを介すなり何なりいくらでもやりようはありますが、既製品でUARTは厄介ですね。

> 高速なSSDがでるのを待つしかないようですね。

8GB SDを分割し(4GB+4GBなど)、基板上の4GB SSDにWindowsシステム、8GB SSDの1つのパーティションをWindowsデータエリアとし、もうひとつのパーティションをLinux領域とし、先般datniodeath様よりご紹介いただいたMBM( http://elm-chan.org/fsw/mbm/mbm.html )や既成のブートローダーなどを使って並立すると、もう少しWindows側が使いやすくなるのではないかと思います。

> この待ち時間を早くする方法を知っていたら、教えてくださいませんか？

個人的な印象では、納得いくだけの環境には現状ならないだろうと踏んでおります。
http://www.potech.jp/pote/archives/2008/07/21-082211.php
上記の対応で何とか使えるようになっているので、安くて高速のSSDが売り出されない限りはこのままでいいや、としました。
中身を見てみましたが、4GB SSD側のほうが早い動作をすると思います。
主に利用するOSがWindowsであれば、初期状態と同じように4GB SSDにWindowsシステムを組んだほうが良いかと思います。

ディスクアクセスがネックとなって待たされることが多いので、とにかくSSDにアクセスさせないようにすることが快適にする方法として効果があると思います。
ほか、SSDをやめてHDDに換装なども効果があるかと思います。